以下の操作で出力することが可能です。法人税の場合は下記になります。
電子申告　→　電子申告一覧　→　国税タブ　→　法人税の「確認」ボタンをクリック　→　申告書を出力

現在、申告freeeでは、

・勘定科目内訳書
・電子申告用決算書
・消費税申告書
・申請・届出

上記について、電子申告送信一覧でのタイムスタンプ付き帳票の結果確認に未対応です。
（受付結果の確認はできます）

これらの送信帳票の確認については下記の方法にてご確認をお願いします。
・e-Taxのメッセージボックスの電子申告送信結果からxmlファイルをダウンロードして、e-Taxソフトでxmlファイルを表示する
・e-Taxソフト(WEB版)のメッセージボックスのPDF出力機能で表示する