「所得・控除」ステップの「寄付金の支出をしましたか？」で入力可能な明細数はふるさと納税の区分において６０明細になっています。
相当数を超えるふるさと納税の支払先がある場合には、集計値で入力して別途明細を紙提出するなどの対応をします（記載方法の詳細については、税務署等にご相談お願いします）。
参考：XMLデータから集計値(年間寄付合計額)を確認する
「ＱＲコード付証明書等作成システム」を利用して、「寄附金控除に関する証明書」のXMLデータをアップロードすると、寄附金控除に関する証明書(PDF形式)が作成でき、そのPDF内に集計値（年間寄付合計額）の表示がされます。
※詳しくは、「ＱＲコード付証明書等作成システムについて」をご覧ください。