過去の年月の給与データは登録できますか？

登録できます。
例えば、現在が「2022年1月」の場合、freee人事労務に「2021年1月」の給与データを登録することができます。

作成が必要な月の従業員情報 及び 勤怠を登録します。
登録後は、給与明細がお手元の過去の給与データと一致しているか確認してください。

給与明細を確定することで、過去の給与データを含んだ賃金台帳の作成が可能になります。

ただし、過去の年月の給与明細を確定する際に、現在登録している「従業員数」よりも給与確定する従業員数が多い場合は追加料金がかかります。