クレジットカードは負債ですので、残高はマイナスもしくは０（ゼロ）が正しい状態です。
マイナスの残高は、カードで買い物をしたがまだ引き落とされていない金額、つまり「未払い残高」を表しています。
- クレジットカードで買い物をし、それをfreee会計上で支出取引として登録
⇒ 「未払い残高」はマイナス金額として累積していきます。 - 銀行からカード利用額が引き落とされ、freee会計上で口座振替として登録
⇒ 累積した「未払い残高」が引き落とし金額分解消されて、クレジットカード残高が０（ゼロ）に近づきます。
※継続的にクレジットカードを利用されている場合は、カードの締め日・支払い日の関係により残高が常にマイナスになることもございます。
詳しくは、「クレジットカードの利用内容を記帳する（一括払い）」のヘルプページをご覧ください。