自動同期の設定をした場合どれくらいの間隔で同期しますか？ – freee ヘルプセンター

タイミングとしては毎週2回、週の初めと終わり付近に同期を実施しています。
ただし、月末月初は負荷が高いので自動同期を実行しない場合があり、その他にも都度負荷を見て実行頻度を減らしたりタイミングを変えているため、必ずスケジュール通りに動くわけではありません。
最低でも1週間～10日に1回程度、同期が自動で行われる、とご理解いただければと思います。

任意のタイミングで同期を実行したい場合は、自動同期の設定をしている状態でも、ホーム画面の「今すぐ同期」をクリックしていただくようお願いいたします。