年末調整をfreeeで電子申告する（手続き編）

1. 事前準備を行う

年末調整の電子申告を行うためには、「e-Tax（国税）」「eLTAX（地方税）」それぞれの電子申告システムにて事前設定が必要となります。

設定手順や準備が必要なものについては、「 年末調整をfreeeで電子申告する（準備編） 」のヘルプページをご覧ください。

2. freee人事労務からfreee申告へ連携する

初回の連携を行う

freee人事労務側で年末調整が完了したら、法定調書作成のためfreee申告に移動します。
その事業所において最初にfreee申告に移動をした際に、申告対象年度の選択と初期設定を行います。

1. freee人事労務の「年末調整」画面で［電子申告］ボタンをクリックします。
   ※ エラーが発生する場合、「 「freee申告年調・法定調書を利用するには、権限の設定変更が必要です」というエラーが出ます 」のヘルプページをご覧ください。
   
2. freee申告へ移動すると「年末調整・法定調書を作成する」の画面が表示されますので、申告対象年度を選択します。
   
   
3. 「年調・法定調書の初期設定をしています」という画面が表示されますのでしばらくお待ちください。
   その後、自動的にfreee申告へ移動します。
   
   

２回目以降の連携について

初回の連携が完了すると、以後は年末調整画面の［電子申告］のボタンをクリックすると、freee申告が直接開きます。

また、freee人事労務側で登録内容の修正を行った場合、自動でfreee申告側のデータは上書きされません。
freee申告の画面で、［申告書作成］メニュー →［連携］→［再連携］ボタンをクリックし、freee人事労務からの変更内容を再連携し上書きします。

3. 基本情報の設定を行う

1. freee申告の［基本情報］メニューを開き、［基本情報］タブをクリックします。
2. 項目を入力して、［保存］します。
   
   

   項目	内容
   法人情報	法人番号がご不明な場合は、国税庁の「 国税庁法人番号公表サイト 」ページよりご確認ください。
   電子申告関連情報	電子申告関連情報に準備編で取得した「利用者識別番号（e-Tax）」「利用者ID（eLTAX）」を入力します。

3. ［申告情報］タブを開き、所轄の税務署を選択し、基本情報を入力して保存します。
   入力内容の詳細は、freee申告の「 基本情報を登録する - 申告情報 」のヘルプページをご参照ください。
   ※ ［税理士情報］タブは、事業者様ご本人が申告される場合は入力不要です。

4. 申告書を作成する

作成する申告書を選択する

1. ［申告書作成］メニューを開き、画面左上の［＋申告書を選択する］ボタンをクリックします。
   
   
2. 各タブごとに作成したい申告書にチェックを入れます。
   ※ 作成必須の申告書は自動でチェックが入ります。
   
   
3. 「作成中の申告書」に、選択した申告書が表示されます。
   
   各申告書はPDF出力することができます。
   詳しくは、本ページの「 参考：申告書のPDF出力を行う 」をご覧ください。
   

主な申告書の種類

freee申告を利用した場合、主な作成可能書類は下表のとおりです。 

申告書の種類		説明	利用プラン		提出先	利用する電子申告システム
			freee会計 + freee人事労務	freee人事労務のみ
源泉徴収票等		従業員に支払った所得と徴収した所得税についてまとめたもの。	〇	〇	税務署	e-tax
支払調書関連		取引先に支払った金額と、徴収した所得税についてまとめたもの。 詳しくは、「 freee申告で支払調書を作成する（会計連携） 」のヘルプページをご覧ください。 ※ freee会計をご利用でない場合は、freee申告または別途ご自身で支払調書を作成します。	〇	△ (freee申告で手動作成)
合計表など	法定調書合計表	源泉徴収票と支払調書の内容をまとめて、所得税について一覧にした書類。 詳しくは、「 freee申告で法定調書合計表を作成する 」のヘルプページをご覧ください。	〇	〇 (freee申告で支払調書を作成した場合)
	給与支払報告書	源泉徴収票のフォーマット＋総括の書類が1枚ついた書類。 従業員に支払った所得と徴収した所得税についてまとめたもの。 詳しくは、「 freee申告で給与支払報告書を確認する 」のヘルプページをご覧ください。	〇	〇	市区町村	eLTAX
税務代理書面		事業者様ご本人が申告される場合は作成不要です。	〇	〇	-	-
管理表 計算書など	年末調整データ一覧表	各従業員の年末調整データの一覧。	〇	〇	-	-
	源泉徴収額納付管理表	月毎の源泉徴収額の一覧。
	年末調整通知書	従業員へ年末調整結果を通知する書類。必要な場合、従業員毎に切り取って配布する。

5. 電子申告データの送信・完了チェック

電子申告データの送信（freee申告での操作）

1. freee申告の［電子申告］メニュー →［電子申告送信］を開きます。
2. 「国税（所得税徴収高計算書を除く）」「所得税徴収高計算書」「市町村民税」の各項目で、提出する申告書と申告に必要な基本情報を確認します。
3. マイナンバーの出力にはチェックを入れます。［送信チェック］のボタンをクリックして、提出データにエラーがないか事前に確認します。
   エラーがなければ、各項目のステータスが「チェック完了」となります。
   
   
   エラーがある場合は、［エラー確認］ボタンが表示され、クリックしてエラー内容を確認することができます。
   
   
   【送信チェックエラーメッセージ画面】
   
   
4. 「市町村民税」の［eLTAXの申告先届出状況を確認］ボタンをクリックし、暗証番号（納税者）を入力して届出が完了しているか確認します。
   
   完了している場合、「届出状況」のステータスが「登録済み」となります。
   

電子申告データの送信（電子申告アプリでの操作）

1. ［個別で送信（電子申告アプリが起動します）］ボタンをクリックします。
   ※ freee申告のアプリを未インストールの場合は、ページ下部［電子申告・申請アプリの使い方について］のリンクからアプリをダウンロードします。
2. freee申告のアプリから送信する手順については、「 freeeで所得税の電子申告を行う（Windows）- 2.freeeで電子申告を行う 」のヘルプページ「ステップ9.」以降をご覧ください。
   

送信状況を確認する

送信状況の確認手順は次のとおりです。

1. ［電子申告］メニュー →［電子申告一覧］を開きます。
2. ［国税］［地方税］タブそれぞれで受付結果を確認することができます。
   
   
3. 各タブの画面で［受付結果を更新する］ボタンをクリックし、e-Tax・eLTAXのパスワードを入力すると、受付結果を問い合わせることができます。
   
   
4. 受付結果のステータスが「受付完了」となっていたら、送信は完了です。
5. ［確認］ボタンから、送信内容の詳細を確認することができます。
   

   ボタン	内容
   受信通知を出力	受付完了通知のPDFを確認することができます。
   送付書ダウンロード	添付書類・送付書のPDFをダウンロードすることができます。
   申告書を出力	給与支払報告書（総括表）のPDFをダウンロードすることができます。タイムスタンプと受付番号が表示されます。

 

---

参考：申告書のPDF出力を行う

［申告書作成］メニューの［PDF出力］ボタンから、出力したい申告書を選択してダウンロードすることができます。

一部の書類を出力する

各種帳簿・各従業員単位で書類を出力することができます。

1. 申告書のPDF出力画面左上のプルダウンから、出力したい書類名を選択します。
2. 一覧から出力したい従業員にチェックを入れます。
   プルダウンの右側のボタンをクリックすると、全てにチェックを入れる／全てのチェックを解除できます。
3. ［PDF出力の開始］をクリックします。
4. 出力結果の欄に［ダウンロード］ボタンが表示されたら、クリックしてPDFをダウンロードします。
   

源泉徴収票、源泉徴収簿を一括で出力する

各種帳簿単位で、全従業員分の書類を一括出力することができます。

1. 申告書のPDF出力画面左上のプルダウンから、［一括選択］を選択します。
2. 「源泉徴収票・給与支払報告書の出力方法を選択する」の項目を選択します。
3. 一覧から出力したい帳票にチェックを入れます。
   プルダウンの右側のボタンをクリックすると、書類の分類毎に自動でチェックが入ります。
4. ［PDF出力の開始］をクリックします。
5. 出力結果の欄に［ダウンロード］ボタンが表示されたら、クリックしてPDFをダウンロードします。

---

参考：電子申告のよくある質問

• freee会計、freee人事労務の数値とfreee申告の数値が違う
• 年末調整の結果を一覧表示する帳票はありますか？
• マイナンバーカードはスマートフォンで読み取れますか？
• freee申告の画面とPDF出力したもので数字が合っていない
• 退職者の源泉徴収票がfreee申告に連携しないです
• 法定調書合計表の源泉徴収税額の金額が違う
• 電子申告一覧で送信チェックを行うとスキーマチェックエラーが出る